Tengo condromalacia grado 1, ¿Cuál sería el mejor tratamiento desde la fisioterapia?

Hace 4 años me lastime la rodilla derecha jugando fútbol (palancazo hacia atrás), posteriormente por pisar mas con el pie izquierdo también me empezó a doler la otra rodilla. Mi fisioterapeuta me mando hacer una resonancia magnética para ambas rodillas y en las 2 aparece que tengo condromalacia grado 1, bursitis, edema y sin embargo la zona donde me duele es ENTRE LA ROTULA Y EL TENDÓN ROTULIANO. Lo raro es que en la rodilla derecha me duele cuando estoy sentado flexionando el pie y en la izquierda cuando estoy de pie o caminado. Durante mi rehabilitación que llevo a cabo realizo gimnasio con ejercicios para fortalecer los abductores, aductores entre otros incluyendo la elíptica. Mi doctora me da fisioterapia con Ultrasonido, electro estimuladores, laser, hielo incluyendo ejercicios de fortalecimiento. Dentro de todas las cosas yo me he estado recuperando lentamente, pero lo raro es que el dolor justamente en esas zonas no mejoran (entre la rotula y el tendón rotuliano), me comenta mi doctora que no entiende por que me sigue doliendo ya que se supone debió haber mejorado con las terapias.